Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
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