Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms