Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
DysfQ9ESD7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms