Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES97

Rtn3, Reticulon-3, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn3Q9ES97 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rtn3Q9ES97 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtn3Q9ES97 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtn3Q9ES97 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtn3Q9ES97 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtn3Q9ES97 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtn3Q9ES97 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtn3Q9ES97 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtn3Q9ES97 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms