Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms