Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms