Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ28

Pold3, DNA polymerase delta subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold3Q9EQ28 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold3Q9EQ28 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold3Q9EQ28 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold3Q9EQ28 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold3Q9EQ28 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold3Q9EQ28 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold3Q9EQ28 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold3Q9EQ28 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold3Q9EQ28 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold3Q9EQ28 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold3Q9EQ28 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold3Q9EQ28 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold3Q9EQ28 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold3Q9EQ28 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold3Q9EQ28 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold3Q9EQ28 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold3Q9EQ28 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold3Q9EQ28 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold3Q9EQ28 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold3Q9EQ28 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold3Q9EQ28 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold3Q9EQ28 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold3Q9EQ28 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold3Q9EQ28 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold3Q9EQ28 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold3Q9EQ28 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pold3Q9EQ28 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms