Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms