Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms