Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rnft1Q9DCN7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rnft1Q9DCN7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Rnft1Q9DCN7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Rnft1Q9DCN7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Rnft1Q9DCN7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Rnft1Q9DCN7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Rnft1Q9DCN7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Rnft1Q9DCN7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Rnft1Q9DCN7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Rnft1Q9DCN7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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