Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcg8Q9DBM0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcg8Q9DBM0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.1 ms