Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms