Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb1Q9DAK3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb1Q9DAK3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms