Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco5aQ9D9D5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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