Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms