Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Q9D8Q6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Q9D8Q6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms