Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gtf3c6Q9D8P7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gtf3c6Q9D8P7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gtf3c6Q9D8P7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gtf3c6Q9D8P7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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