Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Derl3Q9D8K3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Derl3Q9D8K3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms