Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
2310002L09RikQ9D7L5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2310002L09RikQ9D7L5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms