Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MsraQ9D6Y7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms