Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms