Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms