Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2N9

Vps33a, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33aQ9D2N9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps33aQ9D2N9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps33aQ9D2N9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms