Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F8

Toporsl, Topoisomerase I-binding, arginine/serine-rich-like, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ToporslQ9D2F8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms