Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q6

Erp44, Endoplasmic reticulum resident protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erp44Q9D1Q6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Erp44Q9D1Q6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Erp44Q9D1Q6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Erp44Q9D1Q6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Erp44Q9D1Q6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Erp44Q9D1Q6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Erp44Q9D1Q6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Erp44Q9D1Q6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Erp44Q9D1Q6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Erp44Q9D1Q6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Erp44Q9D1Q6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Erp44Q9D1Q6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms