Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms