Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1I5

Mcee, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MceeQ9D1I5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MceeQ9D1I5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms