Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Hddc3Q9D114 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Hddc3Q9D114 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Hddc3Q9D114 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Hddc3Q9D114 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Hddc3Q9D114 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Hddc3Q9D114 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Hddc3Q9D114 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Hddc3Q9D114 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Hddc3Q9D114 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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