Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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