Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms