Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf146Q9CZW6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rnf146Q9CZW6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rnf146Q9CZW6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf146Q9CZW6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf146Q9CZW6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf146Q9CZW6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf146Q9CZW6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf146Q9CZW6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf146Q9CZW6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rnf146Q9CZW6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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