Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW2

Cenpn, Centromere protein N, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpnQ9CZW2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CenpnQ9CZW2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms