Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thumpd2Q9CZB3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms