Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Nde1Q9CZA6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Nde1Q9CZA6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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