Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms