Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nip7Q9CXK8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms