Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc17Q9CXD9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms