Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX47

Xrcc2, DNA repair protein XRCC2, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc2Q9CX47 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Xrcc2Q9CX47 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Xrcc2Q9CX47 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Xrcc2Q9CX47 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Xrcc2Q9CX47 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Xrcc2Q9CX47 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Xrcc2Q9CX47 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Xrcc2Q9CX47 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Xrcc2Q9CX47 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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