Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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