Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms