Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ifitm3Q9CQW9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms