Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms