Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpa3Q9CQ71 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpa3Q9CQ71 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpa3Q9CQ71 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpa3Q9CQ71 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpa3Q9CQ71 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpa3Q9CQ71 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpa3Q9CQ71 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpa3Q9CQ71 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpa3Q9CQ71 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpa3Q9CQ71 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpa3Q9CQ71 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpa3Q9CQ71 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpa3Q9CQ71 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpa3Q9CQ71 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpa3Q9CQ71 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms