Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ28

Dph6, Diphthine--ammonia ligase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dph6Q9CQ28 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dph6Q9CQ28 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dph6Q9CQ28 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms