Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sike1Q9CPR7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sike1Q9CPR7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms