Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms