Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms