Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb2Q99LJ7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms