Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms