Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms